La Academia del Málaga Club de Fútbol está compuesta por numerosos equipos que conforman el fútbol base de la entidad de Martiricos. Las categorías inferiores existentes son de edad Juvenil, Cadete, Infantil, Alevín, Benjamín y Prebenjamín, en las que los jóvenes futbolistas van creciendo como jugadores y también como personas, con el apoyo de un grupo de técnicos y auxiliares que priorizan la formación del futbolista sin obviar el aspecto competitivo. Asimismo, en 2ª Andaluza Sénior, milita un Málaga CF 'C' que acoge -con licencia federativa- a canteranos que juegan en el primer y el segundo equipo blanquiazules.

Los resultados positivos en campeonatos y torneos, así como las habituales citaciones internacionales de jugadores de los escalafones inferiores, avalan el crecimiento progresivo de una cantera que tiene en el Juvenil 'A', que compite en el Grupo 4 de División de Honor, a uno de sus mayores exponentes gracias a sus éxitos cosechados durante las últimas temporadas. Y, a su vez, supone el último paso de los futbolitas antes del ascenso al equipo dependiente del Málaga CF, el Club Atlético Malagueño.