La Academia del Málaga Club de Fútbol está compuesta por numerosos equipos que conforman el fútbol base de la Entidad. Las categorías inferiores existentes son de edad Juvenil, Cadete, Infantil, Alevín, Benjamín y Prebenjamín, en las que los jóvenes futbolistas van creciendo como jugadores y también como personas, con el apoyo de un grupo de técnicos y auxiliares que priorizan la formación del futbolista sin obviar el aspecto competitivo. Asimismo, en 3ª Andaluza Sénior, milita un Málaga CF 'C' que acoge a canteranos que juegan en el primer y el segundo equipo blanquiazules. Los resultados positivos avalan el crecimiento progresivo de una cantera que tiene en el Juvenil 'A' que compite en División de Honor a uno de sus mayores exponentes gracias a sus éxitos cosechados durante las últimas temporadas, y a su vez supone el último paso antes del ascenso al equipo dependiente del Málaga CF, el CA Malagueño.