La Academia del Málaga Club de Fútbol está compuesta por numerosos equipos que conforman el fútbol base de la Entidad. Las categorías inferiores existentes son de edad Juvenil, Cadete, Infantil, Alevín, Benjamín y Prebenjamín, en las que los jóvenes futbolistas van creciendo como jugadores y personas, con el apoyo de un grupo de técnicos que priorizan la formación del futbolista sin obviar el aspecto competitivo. Desde la temporada 2020/21, además, se incluye un nuevo equipo vinculado bajo la denominación de Málaga CF 'C'. Los resultados positivos avalan el crecimiento progresivo de una cantera que tiene en el Juvenil 'A' que compite en el Grupo IV de División de Honor a uno de sus mayores exponentes gracias a sus éxitos cosechados durante las últimas temporadas, y a su vez último paso antes del ascenso al filial del Málaga CF, el Club Atlético Malagueño.